GPS航海导航用户繁多，其分类标准也各不相同，若根据航路类型分别、GPS航海导航可以分为五大类：远洋导航、海岸导航、港口导航、内河导航、湖泊导航。

不同阶段或地区，对航行安全要求也因环境差别而不同，但都是为了保证Zui小航行交通冲突，有用地利用日益拥挤的航路，保证航行安全，提高交通运输效益，节省能源。根据导航系统的功能分别有以下几类：

1、自主导航

自主导航系统适于上述五种航路的任何一种，它基本上是一种单纯的导航体系，其主要特性是仅向用户提供位置、航速、航向和时间信息，也可包括海图航迹显示，不需通信系统。适用于任何海面、湖面和内河上航行的船舶，从大型远洋货轮到私家游艇。

2、港口管理和进港引导

这种系统主要用在港口/码头的船舶调度管理、进港船舶引导，以确保港口/码头航行的安全和秩序。该系统需要双向数据/语音通讯，以便于领航员引导船舶，港区情境/海图显示，以表明停泊的船舶和可利用的进港航线，避免冲突。这种系统对导航系统的精度要求高，要使用差分GPS和其他加强技能。

3、航路交通管理系统

这类体系与2类似，但主要用于近海和内陆河航路上的船舶导航和管理，通常必要卫星通讯系统支持。

4、跟踪监视系统

这类系统主要用于海上巡逻艇、缉私艇及各种游艇，特别是私家游艇以防盗根据具体的使用对象，有些系统需要给出导航参量和双向数据/话音通讯，如缉私艇。而有时则不需要给出导航参量，如用于私家游艇防盗，仅需要单向数据通讯，一旦发生被盗，游艇上的导航系统不停把自己的位置和航向送到有关中心，以便于跟踪。

5、紧急救援系统

系统也包括两栖飞机，直升机和陆地车辆。它适应于所有五类航路，用于搜寻和救援各种海面、湖面、内河上的遇险、遇难船舶和职员。这类系统需要双向数据/话音通讯，要求响应时间快、定位精度高。

6、GPS/声纳组合用于水下机器人导航

该类组合系统可用于水下管道铺设和维修(需要视觉系统)，水文测量以及别的海下作业，如用于港口/码头水下勘测，以便于进场航道阻塞物扫除，保证航道流通，也可用于远洋捕捞，渔船作业引导等。